MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AGA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207329
2	NC_017240	ATT	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207329
3	NC_017240	ATTT	2	8	112	119	25 %	75 %	0 %	0 %	384207329
4	NC_017240	TAG	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207329
5	NC_017240	CAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
6	NC_017240	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
7	NC_017240	TTG	2	6	343	348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207330
8	NC_017240	AAT	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207330
9	NC_017240	A	7	7	743	749	100 %	0 %	0 %	0 %	384207331
10	NC_017240	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
11	NC_017240	A	6	6	840	845	100 %	0 %	0 %	0 %	384207331
12	NC_017240	TAT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
13	NC_017240	TTA	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
14	NC_017240	AT	3	6	934	939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207331
15	NC_017240	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207331
16	NC_017240	CCATC	2	10	1002	1011	20 %	20 %	0 %	60 %	384207331
17	NC_017240	GTTA	2	8	1059	1066	25 %	50 %	25 %	0 %	384207331
18	NC_017240	TGAT	2	8	1116	1123	25 %	50 %	25 %	0 %	384207332
19	NC_017240	CTC	2	6	1125	1130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207332
20	NC_017240	A	6	6	1150	1155	100 %	0 %	0 %	0 %	384207332
21	NC_017240	AG	3	6	1198	1203	50 %	0 %	50 %	0 %	384207332
22	NC_017240	TTA	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
23	NC_017240	TA	3	6	1367	1372	50 %	50 %	0 %	0 %	384207332
24	NC_017240	AAAGG	2	10	1373	1382	60 %	0 %	40 %	0 %	384207332
25	NC_017240	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
26	NC_017240	ATAA	2	8	1412	1419	75 %	25 %	0 %	0 %	384207332
27	NC_017240	CTT	2	6	1431	1436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207332
28	NC_017240	A	6	6	1563	1568	100 %	0 %	0 %	0 %	384207333
29	NC_017240	A	6	6	1571	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	384207333
30	NC_017240	AGAAA	2	10	1583	1592	80 %	0 %	20 %	0 %	384207333
31	NC_017240	TA	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	384207333
32	NC_017240	ATA	2	6	1650	1655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
33	NC_017240	ATG	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207333
34	NC_017240	A	6	6	1672	1677	100 %	0 %	0 %	0 %	384207333
35	NC_017240	TAA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
36	NC_017240	ATA	2	6	1982	1987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207334
37	NC_017240	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207334
38	NC_017240	TGT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207334
39	NC_017240	TATTT	2	10	2080	2089	20 %	80 %	0 %	0 %	384207334
40	NC_017240	AAT	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
41	NC_017240	AGCAA	2	10	2781	2790	60 %	0 %	20 %	20 %	384207335
42	NC_017240	T	6	6	2816	2821	0 %	100 %	0 %	0 %	384207335
43	NC_017240	AAT	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
44	NC_017240	AT	3	6	2837	2842	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
45	NC_017240	A	6	6	2901	2906	100 %	0 %	0 %	0 %	384207335
46	NC_017240	GAA	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207335
47	NC_017240	AT	3	6	2922	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
48	NC_017240	TA	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
49	NC_017240	A	8	8	2967	2974	100 %	0 %	0 %	0 %	384207335
50	NC_017240	TTA	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207335
51	NC_017240	T	6	6	3107	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	384207336
52	NC_017240	T	6	6	3143	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	384207336
53	NC_017240	ATAA	2	8	3165	3172	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
54	NC_017240	ATT	2	6	3177	3182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
55	NC_017240	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	384207336
56	NC_017240	AAC	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207336
57	NC_017240	TAATT	2	10	3236	3245	40 %	60 %	0 %	0 %	384207336
58	NC_017240	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
59	NC_017240	TAAAAA	2	12	3334	3345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384207336
60	NC_017240	AGA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
61	NC_017240	A	7	7	3369	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	384207336
62	NC_017240	TAG	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207336
63	NC_017240	ATTTA	2	10	3403	3412	40 %	60 %	0 %	0 %	384207336
64	NC_017240	AGA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
65	NC_017240	AATA	2	8	3443	3450	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
66	NC_017240	ATT	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
67	NC_017240	ATT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
68	NC_017240	AAT	2	6	3569	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207336
69	NC_017240	ATT	3	9	3594	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
70	NC_017240	ATTT	2	8	3621	3628	25 %	75 %	0 %	0 %	384207336
71	NC_017240	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
72	NC_017240	A	6	6	3798	3803	100 %	0 %	0 %	0 %	384207337
73	NC_017240	AT	3	6	3850	3855	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
74	NC_017240	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	384207337
75	NC_017240	AAAAT	2	10	3937	3946	80 %	20 %	0 %	0 %	384207337
76	NC_017240	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207337
77	NC_017240	AAT	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
78	NC_017240	GAT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207337
79	NC_017240	GAA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
80	NC_017240	TAA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
81	NC_017240	T	6	6	4039	4044	0 %	100 %	0 %	0 %	384207337
82	NC_017240	AT	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
83	NC_017240	A	6	6	4080	4085	100 %	0 %	0 %	0 %	384207337
84	NC_017240	AGA	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
85	NC_017240	ATAA	2	8	4122	4129	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
86	NC_017240	TAAA	2	8	4153	4160	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
87	NC_017240	ATA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
88	NC_017240	A	6	6	4216	4221	100 %	0 %	0 %	0 %	384207337
89	NC_017240	A	8	8	4243	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	384207337
90	NC_017240	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207338
91	NC_017240	AGA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207338
92	NC_017240	TAA	2	6	4764	4769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
93	NC_017240	TAGAT	2	10	4866	4875	40 %	40 %	20 %	0 %	384207338
94	NC_017240	TGA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207338
95	NC_017240	TAAA	2	8	4913	4920	75 %	25 %	0 %	0 %	384207338
96	NC_017240	TAA	2	6	4926	4931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
97	NC_017240	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	384207338
98	NC_017240	TAA	2	6	4950	4955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
99	NC_017240	ATA	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
100	NC_017240	GAT	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207339
101	NC_017240	T	6	6	5312	5317	0 %	100 %	0 %	0 %	384207339
102	NC_017240	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207339
103	NC_017240	A	6	6	5369	5374	100 %	0 %	0 %	0 %	384207339
104	NC_017240	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
105	NC_017240	TAA	2	6	5409	5414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
106	NC_017240	A	6	6	5425	5430	100 %	0 %	0 %	0 %	384207339
107	NC_017240	A	7	7	5436	5442	100 %	0 %	0 %	0 %	384207339
108	NC_017240	ATA	3	9	5498	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
109	NC_017240	TTA	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
110	NC_017240	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207339
111	NC_017240	A	7	7	5633	5639	100 %	0 %	0 %	0 %	384207339
112	NC_017240	A	6	6	5796	5801	100 %	0 %	0 %	0 %	384207340
113	NC_017240	AT	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	384207340
114	NC_017240	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
115	NC_017240	A	8	8	5822	5829	100 %	0 %	0 %	0 %	384207340
116	NC_017240	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
117	NC_017240	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
118	NC_017240	A	7	7	5876	5882	100 %	0 %	0 %	0 %	384207340
119	NC_017240	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
120	NC_017240	ATA	2	6	6536	6541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
121	NC_017240	ATA	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
122	NC_017240	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	384207341
123	NC_017240	TAAA	2	8	6647	6654	75 %	25 %	0 %	0 %	384207341
124	NC_017240	CT	3	6	6665	6670	0 %	50 %	0 %	50 %	384207341
125	NC_017240	T	6	6	6707	6712	0 %	100 %	0 %	0 %	384207341
126	NC_017240	A	6	6	6810	6815	100 %	0 %	0 %	0 %	384207341
127	NC_017240	T	6	6	6843	6848	0 %	100 %	0 %	0 %	384207341
128	NC_017240	AGC	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207342
129	NC_017240	AAG	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
130	NC_017240	AAG	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
131	NC_017240	TAA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207342
132	NC_017240	AT	3	6	7354	7359	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
133	NC_017240	ACA	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
134	NC_017240	GAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
135	NC_017240	A	6	6	7389	7394	100 %	0 %	0 %	0 %	384207343
136	NC_017240	TATTT	2	10	7423	7432	20 %	80 %	0 %	0 %	384207343
137	NC_017240	A	6	6	7487	7492	100 %	0 %	0 %	0 %	384207343
138	NC_017240	TAAA	2	8	7524	7531	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
139	NC_017240	TAG	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
140	NC_017240	A	6	6	7604	7609	100 %	0 %	0 %	0 %	384207343
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